关键词： 参考文献；SCI查重；iThenticate；CrossCheck；查重设置；期刊投稿
一、先搞清楚一个基本问题：你说的“提交”是什么意思？
很多人在问“参考文献要不要提交”的时候，脑子里想的其实是两件完全不同的事：
第一件事：查重的时候，要不要把参考文献删了再上传？ ——这是操作问题。
第二件事：投稿的时候，参考文献算不算在论文里一起交？ ——这是格式问题。
这两件事的答案完全不一样。投稿的时候参考文献必须交——没有参考文献的论文根本就不是一篇完整的学术论文，期刊编辑看到你连参考文献都没列，直接给你退回来。但查重的时候，你不需要手动删除参考文献——系统会自动处理。
很多人把这两件事搞混了，以为“查重时不用管参考文献”就等于“投稿不用交参考文献”，结果闹出了笑话。
所以先记住一个最基本的结论：投稿必须带参考文献，查重不用删参考文献。
二、查重的时候，参考文献到底怎么处理的？
现在说查重。你上传一篇带参考文献的论文到iThenticate（也就是CrossCheck）系统里，系统会默认做一件事：自动识别参考文献部分，并在计算重复率的时候把它排除掉。
怎么识别的？系统会去找文末有没有“References”或者“Bibliography”这样的关键词，找到之后，这个关键词后面的所有内容都会被自动排除在查重计算之外。
所以你在iThenticate的查重报告里，通常会看到两个数字：
包含参考文献的重复率——所有内容都算进去
排除参考文献的重复率——参考文献不算，只看正文
期刊编辑通常看的是排除参考文献的那个数字。因为参考文献列表里全是别人的文章标题和作者名字，查出来肯定是100%重复——这个数字没有任何意义。
iThenticate 2.0版本默认就是排除参考文献的。你上传论文之后，系统自动帮你排好了，你什么都不用做。
三、我能不能自己把参考文献删了再查？
很多人的第一反应是：既然参考文献不算重复，那我直接删了再上传，不是更省事吗？
千万别这么做。
第一，你删了参考文献，查出来的重复率会偏低。为什么？因为查重系统算重复率的时候，分母是“总字数”。你把参考文献删了，总字数变少了，但正文里的重复字数没变——重复字数除以更小的总字数，百分比反而会变大。你以为删了参考文献能降低重复率，结果恰恰相反。
有人做过对比：同一篇论文，带参考文献查，排除参考文献后重复率是12%；删掉参考文献再查，重复率直接变成了16%。删了参考文献反而更高。
第二，你删了参考文献，跟期刊编辑查的内容就不一样了。期刊编辑在投稿系统里收到的是一篇完整的论文——带标题、带正文、带参考文献、带图表。他们用iThenticate一查，系统自动排除了参考文献。你自查的时候删了参考文献，查出来的数字跟编辑看到的数字对不上——你觉得自己重复率12%没问题，编辑一看16%，直接拒了。
第三，参考文献格式不规范的话，系统可能识别不了。如果你的参考文献没有用“References”作为标题，或者标题前后有其他乱七八糟的字符，系统可能找不到这个关键词，就把参考文献当正文一起算了。这时候你带参考文献查，重复率会虚高。但这个问题不是靠删参考文献解决的，而是靠规范格式解决的。
四、不同期刊的要求一样吗？
大部分期刊看的是排除参考文献的重复率，但也有少数例外。
绝大多数SCI期刊——包括Elsevier、Springer Nature、Wiley、IEEE旗下的期刊——看的是排除参考文献后的重复率。IEEE Access的查重报告中会明确标注“参考文献相似比”和“排除参考文献相似比”两个数字。
极少数期刊会要求看包含参考文献的重复率。这类期刊主要集中在医学领域（涉及临床数据重复验证的论文）和交叉学科（需要比对方法论重复性的研究）。
所以投稿前，一定要去目标期刊的官网翻一下“作者指南” ，看看有没有明确说参考文献怎么处理。如果没有明确说，默认按“排除参考文献”处理就行了。
五、参考文献格式怎么弄才能被系统正确识别？
既然系统是靠关键词来识别参考文献的，那格式就很重要。我给你几个最简单的操作要点：
第一，参考文献部分前面一定要单独写一行“References”或者“Bibliography” 。不要写“REF”、“Rferences”这种错别字，也不要前面加任何数字或符号。
第二，References这个词要单独成行，前后不要有其他内容。比如：
（正文内容……）\r\n\r\nReferences\r\n[1] Smith, J. ...\r\n[2] Zhang, L. ...\r\n这样就对了。
第三，References后面最好另起一页，跟正文彻底分开。这样系统更容易识别。
第四，参考文献的格式要统一。不要中文格式英文格式混着来，不要有的有DOI有的没有。格式越规范，系统识别越准确。
六、实际操作中到底该怎么做？
我给你一个最简单的操作流程：
第一步：写论文的时候正常写。该有的标题、正文、图表、参考文献，一个都别少。
第二步：自查的时候，上传完整稿件。不要删任何东西——标题、作者信息、正文、参考文献、致谢，全部上传。
第三步：看查重报告的时候，看排除参考文献的那个数字。iThenticate的报告里会明确标注“Exclude bibliography: ON”（参考文献已排除）或者“Exclude bibliography: OFF”（参考文献未排除）。确保你看到的是ON的那个版本。
第四步：如果重复率偏高，修改正文。不要动参考文献——参考文献不是问题，正文才是。
最后说几句掏心窝的话
参考文献这个问题，说起来简单，但每年都有一堆人在这里栽跟头。
有的人为了省事把参考文献删了查，结果重复率算出来不准，投稿被拒；有的人参考文献格式乱七八糟，系统识别不了，参考文献被当正文算了进去，重复率虚高；还有的人以为“参考文献不算重复”就等于“参考文献不重要”，结果投稿的时候参考文献写得一塌糊涂，直接被编辑退回来改格式。
记住三句话：
投稿必须带参考文献——这是一篇完整论文的基本要求。
查重不用删参考文献——系统会自动排除，你删了反而更糟。
参考文献格式要规范——系统靠关键词识别，格式错了它就识别不了。
这三句话记住了，参考文献这个问题你就再也不会踩坑了。